داشتن نیروی انسانی متخصص، زیرساخت‌ها، تجهیزات، کارگاه‌ها و آزمایشگاه‌های مجهز ویژگی ممتاز آزمایشگاه مرکزی دانشگاه بجنورد بوده و توسعه مستمر این امکانات و تجهیزات از برنامه‌های مهم آن است. این حوزه با تلاش خستگی‌ناپذیر و انجام پژوهش‌های کارآمد، همواره به دنبال رشد علمی شایسته و پایدار در کشور می‌باشد. از مهمترین اهداف آزمایشگاه مرکزی می‌توان موارد ذیل را نام برد:

• ساماندهی امکانات و تجهیزات پیشرفته مورد نیاز دانشکده ها
• تامین نیازهای پژوهشی و فناوری سایر دانشگاه ها و صنایع مستقر در پارک علم و فناوری استان خراسان شمالی، تامین نیازهای آزمایشگاهی صنایع مادر منطقه نظیر صنایع پتروشیمی خراسان، سیمان بجنورد، فولاد اسفراین و آلومینای جاجرم، تامین نیازهای آزمایشگاهی ارگان‌هایی نظیر سازمان استاندارد و گمرک استان
• بهره وری بهینه استفاده از امکانات پیشرفته
• صرفه جویی در هزینه خدمات طرح های پژوهشی و پایان نامه های تحصیلات تکمیلی
• عدم خرید دستگاه‌ها بصورت موازی و فراهم آوردن امکان خرید دستگاه‌های ضروری تر و مورد نیاز استان خراسان شمالی و استان‌های مجاور
• جذب تجهیزات پژوهشی مازاد استان‌های دیگر
• ایجاد ارتباط بیشتر بین پژوهشگران و انتقال اطلاعات
• دسترسی اعضای هیئت علمی و دانشجویان استان به فضاها و امکانات پژوهشی
• پرهیز از انحصاری شدن دستگاه‌ها و تجهیزات پیشرفته
• افزایش رشد علمی دانشگاه و کشور به دلیل انتشار نتایج آزمایشگاهی نظریه‌ها در مجلات معتبرتر
• اتصال به شبکه‌های آزمایشگاهی نظیر شبکه آزمایشگاه‌های علمی ایران (شاعا(، شبکه آزمایشگاه‌های با فناوری راهبردی